Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A0

Gtf2f2, General transcription factor IIF subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f2Q8R0A0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf2f2Q8R0A0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf2f2Q8R0A0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms