Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sf3b4Q8QZY9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b4Q8QZY9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms