Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pof1bQ8K4L4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms