Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r72Q8K3N7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r72Q8K3N7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r72Q8K3N7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r72Q8K3N7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r72Q8K3N7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r72Q8K3N7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r72Q8K3N7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r72Q8K3N7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Vmn1r72Q8K3N7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r72Q8K3N7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Vmn1r72Q8K3N7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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