Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Lrrtm1Q8K377 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
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Lrrtm1Q8K377 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Lrrtm1Q8K377 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Lrrtm1Q8K377 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Lrrtm1Q8K377 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Lrrtm1Q8K377 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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