Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ncapd2Q8K2Z4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ncapd2Q8K2Z4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms