Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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