Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Phf13Q8K2W6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf13Q8K2W6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms