Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Brd3Q8K2F0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brd3Q8K2F0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms