Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hacd3Q8K2C9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hacd3Q8K2C9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms