Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cd300eQ8K249 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300eQ8K249 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Cd300eQ8K249 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cd300eQ8K249 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd300eQ8K249 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd300eQ8K249 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd300eQ8K249 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd300eQ8K249 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd300eQ8K249 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cd300eQ8K249 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cd300eQ8K249 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Cd300eQ8K249 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Cd300eQ8K249 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd300eQ8K249 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Cd300eQ8K249 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Cd300eQ8K249 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd300eQ8K249 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd300eQ8K249 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd300eQ8K249 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd300eQ8K249 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd300eQ8K249 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd300eQ8K249 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd300eQ8K249 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cd300eQ8K249 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300eQ8K249 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300eQ8K249 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd300eQ8K249 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cd300eQ8K249 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Cd300eQ8K249 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms