Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc47a1Q8K0H1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms