Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SbsnQ8CIT9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 386.2 ms