Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam20aQ8CID3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam20aQ8CID3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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