Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Upp2Q8CGR7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Upp2Q8CGR7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms