Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Setd1bQ8CFT2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Setd1bQ8CFT2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Setd1bQ8CFT2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Setd1bQ8CFT2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Setd1bQ8CFT2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Setd1bQ8CFT2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Setd1bQ8CFT2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Setd1bQ8CFT2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms