Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ercc8Q8CFD5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ercc8Q8CFD5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ercc8Q8CFD5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ercc8Q8CFD5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ercc8Q8CFD5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ercc8Q8CFD5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ercc8Q8CFD5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ercc8Q8CFD5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ercc8Q8CFD5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ercc8Q8CFD5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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