Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup88Q8CEC0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup88Q8CEC0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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