Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RybpQ8CCI5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms