Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vwc2Q8C8N3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms