Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssuh2Q8C3L1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssuh2Q8C3L1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssuh2Q8C3L1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssuh2Q8C3L1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssuh2Q8C3L1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssuh2Q8C3L1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssuh2Q8C3L1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssuh2Q8C3L1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssuh2Q8C3L1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssuh2Q8C3L1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssuh2Q8C3L1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssuh2Q8C3L1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssuh2Q8C3L1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssuh2Q8C3L1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms