Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpcpd1Q8C0L9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpcpd1Q8C0L9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpcpd1Q8C0L9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpcpd1Q8C0L9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpcpd1Q8C0L9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpcpd1Q8C0L9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpcpd1Q8C0L9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpcpd1Q8C0L9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpcpd1Q8C0L9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gpcpd1Q8C0L9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gpcpd1Q8C0L9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpcpd1Q8C0L9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms