Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYH8

Chd9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 2,885 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd9Q8BYH8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd9Q8BYH8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd9Q8BYH8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd9Q8BYH8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd9Q8BYH8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd9Q8BYH8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd9Q8BYH8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Chd9Q8BYH8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd9Q8BYH8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd9Q8BYH8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd9Q8BYH8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd9Q8BYH8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd9Q8BYH8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd9Q8BYH8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd9Q8BYH8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Chd9Q8BYH8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Chd9Q8BYH8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Chd9Q8BYH8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Chd9Q8BYH8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Chd9Q8BYH8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Chd9Q8BYH8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Chd9Q8BYH8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chd9Q8BYH8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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