Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWU1

Sprn, Shadow of prion protein, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprnQ8BWU1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SprnQ8BWU1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms