Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cep55Q8BT07 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cep55Q8BT07 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms