Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem87bQ8BKU8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem87bQ8BKU8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem87bQ8BKU8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem87bQ8BKU8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem87bQ8BKU8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem87bQ8BKU8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem87bQ8BKU8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem87bQ8BKU8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem87bQ8BKU8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem87bQ8BKU8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem87bQ8BKU8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem87bQ8BKU8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem87bQ8BKU8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem87bQ8BKU8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem87bQ8BKU8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms