Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan9Q8BJU2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms