Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIV3

Ranbp6, Ran-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ranbp6Q8BIV3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ranbp6Q8BIV3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ranbp6Q8BIV3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ranbp6Q8BIV3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms