Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII1

Prox2, Prospero homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox2Q8BII1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prox2Q8BII1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prox2Q8BII1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms