Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bhlhe23Q8BGW3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe23Q8BGW3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms