Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tmem39bQ810L4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem39bQ810L4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms