Protein–RNA interactions for Protein: Q80YG3

Klhdc1, Kelch domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc1Q80YG3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klhdc1Q80YG3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhdc1Q80YG3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms