Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zbed4Q80WQ9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zbed4Q80WQ9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms