Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnupnQ80W37 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnupnQ80W37 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnupnQ80W37 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnupnQ80W37 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnupnQ80W37 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnupnQ80W37 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnupnQ80W37 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnupnQ80W37 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms