Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmcc2Q80W04 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmcc2Q80W04 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms