Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otop3Q80UF9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otop3Q80UF9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms