Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf516Q7TSH3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf516Q7TSH3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms