Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ckap2lQ7TS74 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ckap2lQ7TS74 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms