Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPV2

Dzip3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, mousemouse

Predictions only

Length 1,204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dzip3Q7TPV2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dzip3Q7TPV2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dzip3Q7TPV2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms