Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Actn1Q7TPR4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Actn1Q7TPR4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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