Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Mycbp2Q7TPH6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Mycbp2Q7TPH6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms