Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL7

Dusp9, Dual specificity protein phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp9Q7TNL7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dusp9Q7TNL7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dusp9Q7TNL7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms