Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zfp397Q7TNK4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp397Q7TNK4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms