Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nphp3Q7TNH6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nphp3Q7TNH6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms