Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rpf1Q7TND5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpf1Q7TND5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms