Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HhipQ7TN16 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HhipQ7TN16 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms