Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uhrf2Q7TMI3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uhrf2Q7TMI3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms