Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim12Q78RX3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim12Q78RX3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms