Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ssh1Q76I79 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssh1Q76I79 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms