Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rph3alQ768S4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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